DIA定量蛋白質(zhì)組
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
DIA技術(shù)主要采用數據非依賴(lài)性采集模式(Data-Independent Acquisition,DIA),通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)將整個(gè)質(zhì)譜掃描質(zhì)量范圍分為若干個(gè)窗口,依次對每個(gè)窗口的所有離子進(jìn)行碎裂,采集全部子離子信息。
研究方法
DIA流程圖
技術(shù)優(yōu)勢
全景式掃描,采集所有離子及碎片譜圖,數據無(wú)遺漏;
鑒定敏感度高,可以鑒定更多低豐度蛋白;
蛋白質(zhì)覆蓋率、定量準確性高;
DIA缺失值更少,結果可重復性高,數據可回溯。
案例解析
家族性帕金森病患者尿蛋白質(zhì)組分析[1]
研究背景
帕金森?。?/span>PD)的患病率正在上升,但是新的治療策略和治療方法的發(fā)展改變了疾病的進(jìn)程,這將得益于特異、敏感和無(wú)創(chuàng )的生物標志物來(lái)早期檢測PD。
研究目的
通過(guò)尿液蛋白組學(xué)進(jìn)行突變攜帶者的突變狀態(tài)和疾病表現進(jìn)行分類(lèi),以及尋找帕金森發(fā)生發(fā)展生物標志物。
研究結果
基于DIA蛋白組學(xué)技術(shù)對家族性帕金森?。?/span>PD)患者的尿液進(jìn)行測序分析尋找,揭示了具有LRRK2 G2019S突變的個(gè)體中溶酶體失調,結合機器學(xué)習,發(fā)現尿蛋白組學(xué)對于PD患者的生物標志物發(fā)現和患者分層具有重要研究?jì)r(jià)值。
基于質(zhì)譜的兩個(gè)獨立尿液PD隊列的蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程
參考文獻
[1] Urinary proteome profiling for stratifying patients with familial Parkinson's disease[J]. EMBO Molecular Medicine, 2021.
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