宏轉錄組測序

技術(shù)簡(jiǎn)介

宏轉錄組 (Metatranscriptomics) 是指從整體水平上研究某一特定環(huán)境，特定時(shí)期群體生命全部基因組轉錄情況以及轉錄調控規律，它以生態(tài)環(huán)境中的全部 RNA 為研究對象，避開(kāi)了微生物分離培養困難的問(wèn)題，能有效的擴展微生物資源的利用空間。相較于宏基因組，宏轉錄組能從轉錄水平研究復雜微生物群落變化，能更好的挖掘潛在的新基因。

技術(shù)路線(xiàn)

送樣建議

技術(shù)參數

案例分析

宏轉錄組揭示浮游植物與海洋細菌之間的相互作用^[1]

研究背景            

遍布世界海洋、結構復雜的單細胞藻類(lèi)——硅藻會(huì )在一種細菌存在時(shí)以更快的速度生長(cháng)，這一細菌能夠釋放一種已知的可以加速陸地植物生長(cháng)的激素。

研究目的

通過(guò)宏轉錄組和代謝組學(xué)探索這一現象發(fā)生機制。

研究結果

研究證實(shí)這些細菌與硅藻發(fā)生物質(zhì)交換，轉而生成了一種由生活在陸地植物根部周?chē)奈⑸锷傻募に?，進(jìn)而促使硅藻生長(cháng)加速。

圖1.多菌體的進(jìn)化系統

參考文獻

[1].  Amin, S. A. et al.. Interaction and signalling between a cosmopolitan phytoplankton and associated bacteria. Nature 522, 98-101, doi:10.1038/nature14488 (2015).